Arrêt de travail : faut-il informer son employeur ?

Le Code du travail le définit comme une « période de suspension du contrat de travail en raison d’une maladie ou d’un accident du travail d’origine professionnelle ou non professionnelle. L’arrêt de travail est justifié par une prescription médicale ». Celle-ci, souvent appelée « certificat médical », peut être réalisée par votre médecin traitant, un médecin de garde, votre sage-femme, un urgentiste ou autres spécialistes. Ce professionnel de la santé définit la durée de votre arrêt de travail, selon votre état de santé. 

Votre contrat de travail étant suspendu, vous avez droit à une indemnisation journalière (IJ) versée par l’Assurance maladie. Elle est égale à 50 % de votre salaire journalier de base, calculé sur la moyenne des salaires bruts des trois derniers mois (communiqué par votre employeur). L’IJ vous est généralement versée à partir du quatrième jour d’arrêt de travail dit « initial ». En effet, les trois premiers jours, appelés délai de carence, correspondent au traitement de votre dossier par l’Assurance maladie. Une prolongation d’un arrêt maladie n’engendre pas de tel délai.  

Votre employeur peut, selon votre contrat, vous verser une indemnisation complémentaire.

Depuis avril 2024, si vous êtes en arrêt pour maladie non professionnelle, vous avez droit à deux jours ouvrables de congés par mois d’absence. Et depuis septembre 2025, si vous tombez malade pendant vos vacances, vous pouvez reporter vos congés payés. Pour en bénéficier, vous devez entreprendre les mêmes démarches que si vous étiez au travail. 

Une fois votre arrêt de travail prescrit, vous devez informer votre employeur par téléphone, par mail ou par SMS.  

Dans les 48 heures, vous devez compléter et envoyer le formulaire sécurisé (c’est-à-dire votre « certificat médical ») que votre médecin vous a remis. Le délai pour réaliser cette démarche administrative vaut autant pour un arrêt de travail que pour une prolongation. Le formulaire compte trois feuillets :  

• les deux premiers feuillets doivent être envoyés à votre caisse d’assurance maladie (CPAM ou MSA) pour bénéficier d’indemnités journalières. Votre médecin se charge souvent de cet envoi s’il dispose d’un téléservice de l’Assurance maladie.

• le troisième feuillet est à remettre à votre employeur, en main propre ou par courrier postal. Si vous êtes à la recherche d’un emploi, vous devez l’envoyer à votre agence France Travail. Si vous avez plusieurs employeurs, une photocopie de ce feuillet peut être distribuée à chacun d’eux. Enfin, vous gardez ce feuillet si vous êtes travailleur indépendant.  

La raison de votre arrêt de travail est couverte par le secret médical. Elle ne figure donc pas sur la feuille remise à votre employeur (ou France Travail). Seuls les dates de votre arrêt de travail et un possible lien avec une grossesse, un accident ou une maladie professionnelle y sont précisés.  

En cas de non-respect des 48 heures, vous risquez une sanction disciplinaire auprès de votre employeur. Un retard d’envoi des deux premiers feuillets à l’Assurance maladie, et en cas de récidive dans les 2 ans, conduisent à une retenue financière (50 % de vos IJ). Celle-ci ne s’applique pas si vous avez été hospitalisé ou pouvez justifier de l’impossibilité de réaliser cette démarche.  

Pendant votre arrêt de travail, vous devez respecter les prescriptions de votre médecin, les interdictions ou les horaires de sortie et vous abstenir de toutes activités. Dans le cadre de la lutte contre la fraude, l’Assurance maladie peut aussi réaliser une visite de contrôle, vous convoquer auprès d’un service médical ou en visioconférence avec un médecin conseil. Un refus ou un non-respect des conditions de votre arrêt de travail peut conduire à une réduction, voire une suppression de vos IJ. Ce contrôle peut, en outre, être demandé par votre employeur à l’Assurance maladie, tout en respectant votre vie privée.  

Votre employeur n’a pas à vous solliciter, même en télétravail, pendant votre arrêt de travail.  

Il n’y aucune démarche administrative à réaliser lorsque vous reprenez votre activité professionnelle. Il en va de même auprès de France Travail, si vous êtes demandeur d’emploi.  

Si vous avez été en arrêt plus de 30 jours, vous reprendrez votre activité après une consultation avec la médecine du travail. Cette visite médicale de reprise peut être l’occasion de prévoir des aménagements de votre poste ou de votre temps de travail (temps partiel thérapeutique, par exemple). Si vous ne pouvez plus occuper votre ancien poste, des formations professionnelles peuvent vous être proposées.  

Enfin, un arrêt de travail pour burn-out ou épuisement professionnel est fréquent (respectivement 34 % et 7 % des salariés concernés en 2024). Certaines entreprises mettent en place une culture d’écoute et de sensibilisation pour favoriser le bien-être des salariés. Celles qui comptent plus de 50 salariés ont d’ailleurs l’obligation de mettre en place diverses initiatives pour assurer la Qualité de vie et des conditions de travail (QVCT).  Cette approche a pour objectif « le bien-être au travail ». Aussi, des formations à la gestion du stress, des programmes de prévention peuvent être instaurés sur votre lieu de travail.